《向井荒太的动物日记》讲述了獸醫系三年級學生向井荒太（堂本剛飾演）的一段惊险而温馨的成长故事。这位宇宙无敌鈍感、低血壓的青年，在一次帮助死党損友惠美梨（山田麻衣子飾演）和阿滿（秋山純飾演）作弊的事件中，却因被教授逮个正著而被罚到动物医院帮忙。

荒太在动物医院里经历了一系列精彩纷呈的动物騷動，其中包括与拉布拉多犬羅希南德的深刻交情。由于收养了失去主人的羅希南德，荒太不得不离开公寓，只好搬入女生宿舍。在新的环境中，他与惠美梨、阿滿三人面对源源不絕的災難，展开了一场突破困難的奇幻冒险。