电影《山茶花飘零》发生在享保15年，讲述了扇野藩平山道场的“四天王”之一，瓜生新兵卫（冈田准一 饰）因揭发上司不正当行为而被放逐出藩的故事。与他同行的妻子篠在（麻生久美子 饰）临终之际，将自己的愿望交托给丈夫：“我希望你能回藩，帮助采女。”

采女（西岛秀俊 饰）是平山道场“四天王”之一，对新兵卫来说既是朋友，也是竞争对手。在妻子的遗愿和寻找扇野藩过去真相的驱使下，新兵卫决定回到故乡。他找到确凿的证据后，与采女展开激烈对峙。然而，在新兵卫追求真相的过程中，他发现背后隐藏着一股强大的力量，试图阻止他揭露扇野藩的丑闻。

尽管新兵卫了解了过去的丑闻，明白了妻子真实的愿望，但他发现自己面临着巨大的压力和威胁。这股力量的目的是什么？