电影《血染黎明》背景设定在一八九四年,日军侵占了旅顺,带来了百姓的苦难。故事聚焦于阿婵(刘秀萍饰)和她的爱人阿贵(关礼杰饰),以及阿丽(周慧敏饰)在这个战乱时期的命运。
阿婵为了救爱人阿贵,不幸遭受了日军天野(郑家生饰)的强奸,这一经历让阿贵深感内疚。随后,阿贵和婵失散,并受伤,最终被一个厌恶战争的日军仓田(余家伦饰)救回日本。
几年后,阿贵在日本学到了制造军火的技术,正当义和团在中国兴起,他认为可以为救国出一份力,于是决定返回中国并效忠义和团,与康大人(鲍方饰)一起制造军火。
阿贵重逢了婵和丽,婵已经成为了义和团的圣母,她希望能够与阿贵重新开始。而丽则沦落为青楼女子,但阿贵对她的感情由怜生爱,三人之间产生了一段错综复杂的三角恋情。
然而,阿贵渐渐发现义和团并非他所期望的抗争力量,感到失望的他和丽选择了隐居田园。但命运却对他们不利,他们被义和团的大师兄所捉,被指控勾结洋人,面临着死亡的威胁。