《远去的“北京人”》是一部以抗日战争时期为背景的电影，讲述了一段充满悬疑和情感纠葛的故事。在战乱的年代，失踪的“北京人”化石成为了中国和世界人类学界以及考古学界的谜团，令人们不断追寻着其下落的真相。

故事聚焦于几位年轻人，他们怀揣着不同的政治信念和隐秘使命，却在战乱的背景下始终牵挂着“北京人”化石的研究、保护和流转情况。一方面，他们积极寻找“北京人”的下落，希望能够找到这一重要化石的踪迹，解开半个世纪以来的谜团，同时也期待能够为国家文化遗产的保护作出贡献。另一方面，他们之间的情感纠葛、利益冲突以及命运的抗争也随之展开。

在追寻真相的过程中，这几位年轻人因为“北京人”化石的命运而产生了不同的观点和态度，彼此之间也产生了难以言表的情感纠葛。