电影的故事发生在千年前，穿越时空的爱情和勇敢的抗争构成了影片的核心。

故事的主线围绕着赤月公主展开，她与儿时好友将军凌川以及前朝三皇子等人一起，奋起抗击邪恶势力，拯救百姓，并揭示了青釬和倚天两把神剑合并后的重大秘密。

历代皇帝都梦想得到青秆和倚天两把神剑，认为这是夺取天下的关键。然而，这两把神剑都隐藏着巨大的秘密，没有一位皇帝能够识破。

在今朝，皇后为了夺取江山，听信术士之言，将一个在阴年、阴月、阴时出生的女婴取名为赤月，并温养青秆剑。赤月公主聪慧过人，女皇对她的宠爱日益加深，并打算将皇位传给她。

然而，阴谋在背后悄然滋长。男宠张中昌和西域巫师阿古娜勾结，各怀鬼胎，计划夺取青釬和倚天两剑以篡夺权位。更神秘的是，还有另一股势力在背后操控这一切。

赤月公主看透了这些阴谋，为了保护女皇和拯救百姓，她与儿时的好友将军凌川、前朝三皇子等人一起，勇敢地抗击邪恶势力。然而，随着抗争的深入，他们不仅揭示了青釬和倚天两剑合并后的惊人秘密，还发现了更大的阴谋。