在美国驻古巴关达那摩湾的海军基地，一桩重大的军事案件引发了广泛关注。两名海军陆战队员，道森和多尼，被指控杀害了另一名士兵圣地亚哥。这一案件成为了电影《好人寥寥》的故事背景，展现了军事法庭内外的较量与真相之争

影片中，海军律师丹尼尔·卡菲（汤姆·克鲁斯饰）和他的助手山姆被派遣前往处理这一案件。起初，卡菲计划进行庭外协调，争取较轻的刑罚，但很快发现两名士兵坚称自己无罪，并且揭示出圣地亚哥曾举报过道森的不当行为。这使案件变得更加复杂，因为士兵们声称他们只是执行了上级下达的“红色条规”，而这些规定实际上是一种不被正式承认但军方默许的私下训诫规定。

卡菲、山姆以及另一名女律师盖洛维（黛米·摩尔饰）组成了辩方律师团队，开始了艰难的调查。然而，他们面临着证据不足的困境。而在整个案件中，基地指挥官杰塞普上校（杰克·尼科尔森饰）成为了关键人物，他拒绝了圣地亚哥的调离申请，并下达了“红色条规”，同时篡改了飞行记录。

卡菲虽然明白真相，但在证据不足的情况下，他面临着艰难的抉择，是否指证杰塞普上校，即使这可能会给自己带来麻烦。电影《好人寥寥》通过法庭内外的较量和角色之间的真相之争，呈现了一个扣人心弦的故事，引发观众对正义与道德的深刻思考。