托马斯（迪伦·奥布莱恩饰）领导的林间斗士在克服了迷宫和末日丧尸的种种考验后，迎来了最后的决战。电影中，托马斯和他的伙伴们，如纽特（托马斯·桑斯特饰）率领的营救团队，经过三年的筹划，决定营救被WCKD组织抓走的米诺
然而，任务并不像他们所预期的那样简单。当他们到达火车所在地时，却发现米诺并不在那列火车上。经过艰苦的调查，他们终于得知米诺深陷WCKD组织的控制之下。此时，托马斯和纽特不得不决定前往人类最后的净土，被称为“最后之都”的地方，以及特蕾莎（卡雅·斯考达里奥饰）这个曾经背叛过他们的人。
这一决定充满了风险，因为他们必须渗透WCKD组织的内部，以拯救米诺和其他人。
