电影《东海客栈》背景设定在抗日战争的关键时刻,1942年,浙东地区的日军占领了港口,并不断向日本本土输送物资。在这个危急的时刻,活跃在这一带的新四军浙东纵队决定采取行动,破坏日军的交通线,打击敌人。他们决定在宁波和舟山之间的嘉海县建立一个秘密联络站,以进行情报传递和抵抗组织。
为了建立这个重要的联络站,纵队司令员派遣了侦察队长陆阿根前往嘉海,并选择了位于嘉海的东海客栈作为联络站的基地。东海客栈是由舅妈余张氏经营的,她同意了这个危险的任务。在鞭炮声中,东海客栈重新开业,但这一次,它的使命不再是一家普通的客栈,而是一个秘密的抗日据点。
嘉海地区的情况复杂,不仅有日军的存在,还存在着内部的明争暗斗。日军警备司令铃木大佐与特务机关长斋藤中佐意见不合,而刘业明积极投靠铃木,赖家山则跟着斋藤,形成了两派明争暗斗的局面。与此同时,新四军侦察队的队员们,包括武功队长晓荷、军统特务蒋美美、日本间谍风信子、特工海葵,都聚集在嘉海,各自施展计谋,展开了一场激烈的情报战。