讲述在三国时期战乱四起，年轻的华佗在家乡杭州给所有的百姓看病，过着平静安逸的生活。华佗凭借超高的医术让太守的女儿明心起死回生，因此拥有神医的美名，也与明心产生纠葛，此时为了研制麻沸散给明心治疗眼疾，开始四处游历寻找药物，华佗在都城与英雄关羽、曹操以及师兄吴思德发生交集，见识到人心的险恶和世态炎凉，最让人接受不了的是心爱的姑娘明心却遭吴思德的霸占。内心绝望的华佗在东昊山中，受到高人指点，幡然醒悟立志要成为济世悬壶救人的大医。通过赤壁之战，刮骨疗伤，华佗经历各种险境，任凭任何的苦难也不会更改华佗内心拯救沧桑的愿望，随着麻沸散研制的成功，也最终让华佗与明心修成正果，就在幸福到来之时，曹操将华佗抓走，使这位妙手回春的大医直接死在狱中