《东方少年》讲述的是在战国时期，由鬼怪掌握的世界的时代，少年武藏和小次郎为了成为最强的武士团而奋力前进赢得比赛的故事。

在战国时期，日本已经成为了鬼怪的天下，人类已经遭受了更多的祸害，此时少年武藏和小次郎不忍鬼怪的摧残，势要成为最强的武士团，与鬼怪进行奋斗，为了恢复人类的正常生活。在武藏和小次郎约定长大之后成为武士团的约定知识此时，武士团也受到了鬼怪的蛊惑，成为了妖魔化的团体，成为了被人类所唾弃的武士团，在这样的大环境下，小次郎和武藏能否完成自己当时的约定，能否将武士团再一次的拉回正轨，也完成自己心目当中的梦想。非常值得期待。不同武士团之间的斗争能否结束，成为天下一统也是武藏和小次郎二人的心愿。