魔法少女小圆是一部披着动漫外衣的哲学作品，这是一个关于小圆成为魔法少女过程的作品，而不是其成为魔法少女之后发生的故事，题目“魔法少女”即是这部作品的终点，这也使得“小圆”成为了关于魔法少女这类动漫中前史一般的存在，最后的结局也在阐述这个世界为什么会有魔法少女这种类型的动漫，魔法少女这个种类又是如何产生的，以及懦弱的小圆为何最后总是能做出各种超出自己想法局限的决定，这就是这部动漫作品所要表达的主旨

这部动漫主要讲述一个平凡的中学生鹿目圆，是一个性格温顺且富有爱心的好孩子，然而转学生晓美焰的到来让小圆的生活产生了巨大转变，一日，小圆在街边救下了一只浑身是伤的神秘生物丘比，而会说人类语言的丘比要求小圆和它签订一份契约，成为魔法少女，在努力成为魔法少女的战斗中，小圆发现了一个关于自己命运的残酷真相。