飞虎3是一部警匪悬疑剧，该片讲述了一支由飞虎队队长和警察所组成的特别行动组，为了剿灭香港的恐怖组织，所展开一系列行动和计划的故事

一个名为瓦甘布的恐怖组织逐渐扩散到了香港，在香港掀起了一场风暴，飞虎队的队长在此时临危受命，率领飞虎队与恐怖组织展开了一场惊心动魄的战斗，此时飞虎队却遭到了恐怖组织的无情针对，进而遭到了围杀，警方的特勤队开始展开救援，面对此时的重重危机，国际刑警的小队队长暂时抛下了之前的爱恨情仇，与飞虎队开始联手阻止化学病毒武器在香港的蔓延，两个小队在这之间发生了很多的纠缠，为了能够成功救出人质，找到化学武器的箱子，牺牲了很多的成员，意想不到的是，此时的化学物品竟然遭到了外泄。